La facturation électronique devient incontournable pour les entreprises, alors que de plus en plus de pays la rendent obligatoire, notamment en Europe. Les gouvernements accélèrent son adoption en imposant l’utilisation de factures électroniques pour les transactions aussi bien dans le secteur public que privé.
En France, par exemple, la réception des factures électroniques sera obligatoire à partir de septembre 2026. Face à l’évolution des réglementations et à la recherche de solutions plus performantes, choisir le bon logiciel de facturation électronique est plus crucial que jamais.
Dans cet article, nous vous présentons cinq plateformes de facturation électronique incontournables pour 2025 et vous aidons à identifier celle qui répondra le mieux aux besoins de votre entreprise.
Point Clés
Les 5 meilleurs logiciels de facturation électronique sont :
Qu’est-ce qu’un Logiciel de Facturation Électronique ?
Un logiciel de facturation électronique est une solution numérique qui permet aux entreprises de créer, envoyer, recevoir et traiter des factures de manière dématérialisée. Contrairement aux factures papier ou PDF envoyées par e-mail, ces logiciels assurent un échange sécurisé et conforme aux réglementations en vigueur.
La facturation électronique fonctionne de manière similaire à la banque en ligne : elle remplace les chèques et la gestion manuelle des paiements par un processus entièrement numérique, rendant les transactions plus rapides et plus fiables.
Top 5 des logiciels de facturation électronique en 2025
Klippa DocHorizon
Klippa DocHorizon est une plateforme IDP (Intelligent Document Processing) qui utilise une technologie OCR basée sur l’IA pour la numérisation, la classification, l’anonymisation, l’extraction et la vérification des données des documents. Conçue pour les entreprises cherchant une solution simple et efficace d’extraction de données, elle est particulièrement adaptée aux organisations disposant de workflows établis souhaitant intégrer un traitement automatisé des factures.
La plateforme Klippa est un point d’accès certifié PEPPOL, permettant aux utilisateurs d’intégrer immédiatement le réseau PEPPOL et d’échanger des données avec un ID attribué. Cela garantit une conformité totale avec les normes de e-procurement en vigueur en Europe.
Avec DocHorizon, les utilisateurs peuvent convertir, envoyer, recevoir, traiter, vérifier et archiver automatiquement tous leurs documents électroniques en masse.
Avantages
- Envoyez et recevez des factures électroniques dans tous les formats requis
- Convertissez les factures PDF en formats EDI comme XML et UBL
- Extrayez automatiquement les données des factures entrantes grâce à l’OCR intelligent de Klippa
- Évitez la fraude avec un système de validation 2-way matching
- Restez conforme aux réglementations de facturation électronique dans plus de 50 pays
- Archivez vos factures en toute sécurité pendant 10 ans
- Protégez vos données grâce à un logiciel certifié ISO 27001 et conforme au RGPD
- Intégrez facilement la solution à votre ERP, CRM, SRM ou autres systèmes financiers
Inconvénients
- Ne permet pas de générer des factures originales ou personnalisées
- Ne dispose pas d’une fonctionnalité de signature électronique intégrée
Idéale pour : PME, ETI et GE.
Yooz
Solution cloud d’automatisation des comptes fournisseurs, Yooz permet la capture, le traitement et l’archivage des factures électroniques grâce à l’intelligence artificielle et à l’OCR. Elle s’intègre avec plus de 250 ERP pour une gestion fluide des paiements et de la comptabilité.
Avantages
- Possibilité d’envoyer et recevoir les factures électroniques
- Conversion de PDF aux formats structurés comme UBL, CII ou factur-X
- Intégration aisée avec plus de 250 ERP et outils compta
- Archivages des factures pendant 10 ans
- Détection des fraudes
Inconvénients
- Interface utilisateur parfois jugée difficile à prendre en main.( capterra)
- Problèmes occasionnels dans l’extraction des données. ( capterra)
Idéale pour : PME, ETI et TPE.
Sy by Cegedim
Spécialiste de la dématérialisation et de la gestion des flux documentaires, Cegedim propose des solutions de facturation électronique conformes aux réglementations internationales, notamment via sa plateforme SY by Cegedim. Elle facilite l’échange sécurisé de factures entre entreprises.
Avantages
- Possibilité d’envoyer et recevoir les factures électroniques
- Conversion de PDF aux formats structurés comme UBL, CII ou factur-X
- Conformes aux régulations internationales
- Archivages des factures pendant 10 ans
- Reporting complet des factures traitées
Inconvénients
- Les services proposés peuvent être onéreux pour certaines entreprises.
- Utilisation compliquée. (capterra)
Idéale pour : GE, ETI et PME.
DocuWare
Plateforme de gestion documentaire et d’automatisation des processus métier, DocuWare intègre la facturation électronique en offrant des outils de numérisation, d’approbation et d’archivage des factures. Elle s’adresse aux entreprises cherchant à fluidifier leur gestion administrative.
Avantages
- Envoi des factures via email, EDI ou portail
- Capture et validation des factures automatisées
- Propose différents workflows selon vos besoins (les rappels automatiques, conditions de paiements…)
- Signature électronique disponible
Inconvénients
Idéale pour : ETI, GE et PME
Abby
Spécialisée dans la reconnaissance optique de caractères (OCR) et l’intelligence artificielle, ABBYY propose des solutions comme FlexiCapture, permettant d’extraire automatiquement les données des factures pour une intégration fluide dans les systèmes comptables et ERP.
Avantages
- Possibilité d’envoyer et recevoir les factures électroniques
- Rapprochement des factures avec les bons de commande
- Conformes aux régulations internationales
- Intégration avec les systèmes existants
- Archivages des factures pendant 10 ans
- Vérification avec humain dans la boucles
Inconvénients
- Complexité initiale de mise en œuvre.
- La précision des données extraites peut être améliorée. (capterra)
Idéale pour : GE, ETI et PME.
Quelles Fonctionnalités Rechercher ?
Choisir le bon logiciel de facturation électronique commence par identifier les fonctionnalités essentielles qui correspondent aux besoins spécifiques de votre entreprise. Pour vous aider dans votre sélection, voici une liste des fonctionnalités les plus importantes à prendre en compte :
Conformité PEPPOL :
- Connexion certifiée : Assurez-vous que le logiciel est certifié par l’Autorité PEPPOL pour garantir l’échange de factures au sein du réseau PEPPOL, conformément aux normes techniques et fonctionnelles en vigueur.
- Intégration avec un point d’accès PEPPOL : Un point d’accès est un passage sécurisé permettant l’envoi et la réception des factures via PEPPOL. Sans cela, il est impossible d’échanger des e-factures avec les administrations publiques ou d’autres entreprises du réseau.
- Gestion de divers documents : Le logiciel doit prendre en charge les factures, avoirs et bons de commande pour assurer une cohérence dans la gestion des transactions.
Support des Normes Locales :
- Formats spécifiques aux pays : Exemple : XRechnung et ZUGFeRD en Allemagne, FatturaPA en Italie, Factur-X en France, UBL aux Pays-Bas. Sans ces formats, les factures risquent d’être rejetées par les autorités fiscales.
- Champs de données obligatoires : Numéro d’identification fiscale, date et numéro de facture, détails du vendeur et de l’acheteur, description des articles, quantités, prix unitaire, ventilation des taxes et montant total.
Échange Automatisé des Données :
- Connexion directe aux portails gouvernementaux : Par exemple, en Espagne, l’intégration avec le système SII permet un reporting en temps réel à l’administration fiscale. En Italie, FatturaPA impose la transmission via le portail SDI.
- Communication avec les fournisseurs : Réception des factures directement dans le système pour limiter la gestion manuelle des emails.
Extraction et Validation des Données :
- Technologie OCR avancée : Extraction automatique des données des factures PDF, images scannées ou photos prises avec un smartphone. Un OCR basé sur l’IA permet de traiter plusieurs langues et des mises en page complexes.
- Correspondance intelligente : Vérification des données des factures avec les bons de commande ou les bordereaux de livraison (correspondance à 2 ou 3 niveaux). Exemple : si une facture mentionne 100 articles livrés, le système compare avec la commande et le bon de livraison pour éviter tout paiement excessif.
- Détection des doublons : Alertes en cas de facture en double avec les mêmes références (numéro, date, fournisseur).
Automatisation des Workflows :
- Routage automatique : Envoi des factures aux approbateurs en fonction de critères prédéfinis (montant, département). Exemple : les factures < 500 € vont à un gestionnaire junior, celles > 500 € à un cadre supérieur.
- Intégration aux systèmes ERP et comptables : Connexion directe avec SAP, QuickBooks, etc., pour éliminer la saisie manuelle et accélérer le rapprochement comptable.
Validation en Temps Réel :
- Prévention des erreurs : Vérification du respect des réglementations locales (exemple : TVA 19 % en Allemagne, 20 % au Royaume-Uni) et de la numérotation correcte des factures.
- Conformité aux schémas techniques : Validation des formats XML ou JSON requis.
- Corrections automatiques suggérées : Identification des erreurs (ex. : TVA manquante, total incorrect) et recommandations pour les corriger.
Signatures Numériques :
- Validité légale : Conformité aux normes comme eIDAS (UE) ou ESIGN (États-Unis) pour rendre les factures numériquement signées juridiquement contraignantes.
- Outils de vérification : Contrôle des signatures numériques des factures entrantes pour éviter la fraude.
Sécurité et Conformité :
- Certification ISO 27001 : Assure une gestion stricte des données financières sensibles.
- Conformité au RGPD : Protection des données personnelles et financières conformément aux réglementations européennes.
Bien que cette liste couvre les fonctionnalités clés à rechercher, chaque entreprise a des besoins uniques. Utilisez ce guide pour affiner votre choix en fonction de votre secteur, de la taille de votre organisation et de votre croissance future.
Comment Choisir le Meilleur Logiciel de Facturation Électronique ?
Maintenant que vous êtes familier avec les meilleures options de logiciels de facturation électronique et les fonctionnalités clés à prendre en compte pour 2025, vous pouvez commencer à choisir celui qui correspond le mieux aux besoins de votre entreprise.
Pour simplifier le processus de sélection, nous avons divisé les étapes en six étapes faciles à suivre :
1. Évaluez vos besoins actuels
Commencez par identifier ce que vous attendez du logiciel. Cherchez-vous une solution complète capable de générer, envoyer et recevoir des factures avec des fonctionnalités avancées de traitement, ou avez-vous besoin d’un outil plus simple pour créer et envoyer des factures à vos clients de petite taille ?
Faites une liste de vos fonctionnalités incontournables et des éléments négociables qui peuvent être ajoutés via le support du fournisseur ou des personnalisations (par exemple, des modèles de factures spécifiques). Une fois que vous avez compris les fonctions principales dont vous avez besoin, vous pourrez facilement éliminer les logiciels qui ne possèdent pas ces caractéristiques essentielles ou éviter ceux qui proposent des fonctionnalités inutiles que vous ne souhaitez pas payer.
2. Renseignez-vous sur les lois locales de la facturation électronique
Recherchez les règles de facturation électronique dans le pays ou l’État où vous exercez votre activité. Y a-t-il des mandats que vous devez suivre maintenant ou dans un avenir proche ?
Vérifiez que le logiciel que vous envisagez prend en charge :
- Les formats de factures obligatoires (par exemple XML, JSON) compatibles avec vos systèmes gouvernementaux.
- L’extraction des champs de données spécifiques pour des calculs de taxes précis.
- La conformité avec les normes de sécurité, comme les certifications et les règles d’archivage (par exemple, toutes les données doivent être stockées dans le pays).
- L’intégration avec les systèmes gouvernementaux via une connexion API.
Important ! Si vous traitez avec des organisations du secteur public en Europe ou si votre pays impose la facturation électronique avec des exigences spécifiques, la conformité PEPPOL est souvent une fonctionnalité indispensable. L’idée générale est qu’à terme, tous les pays européens passeront à PEPPOL pour un échange de données uniforme et fluide.
Recherchez des logiciels certifiés conformes PEPPOL et vérifiez qu’ils se connectent à un point d’accès PEPPOL. C’est ainsi que votre système pourra se connecter au réseau PEPPOL et échanger des factures avec d’autres participants.
3. Définissez votre budget
Commencez par identifier les coûts. Décomposez les coûts d’investissement en sous-catégories comme la licence du logiciel, l’implémentation et les frais récurrents :
- Licences logicielles : Est-ce un abonnement, des frais par facture ou un tarif unique ?
- Frais d’implémentation : Quels sont les frais pour la personnalisation, l’intégration, la migration des données et la formation ?
- Frais récurrents : Quelles sont les dépenses pour l’assistance technique, les mises à jour logicielles et les corrections de bugs ? Si vous avez besoin de traiter des paiements, y a-t-il des frais de transaction ou des frais supplémentaires ?
Ensuite, calculez votre ROI (Retour sur Investissement) :
Identifiez les employés impliqués dans la gestion des factures et le traitement des paiements. Demandez-leur d’estimer le temps passé à créer des factures, envoyer des rappels, relancer les paiements et effectuer des saisies de données manuellement. Calculez le coût de ce temps en fonction de leur taux horaire.
Évaluez les intérêts générés par les paiements anticipés et les économies réalisées sur les frais de retard. Analysez les données passées pour déterminer combien vous pouvez réduire les erreurs de facturation et les coûts associés. Basez vos calculs sur des estimations réalistes.
Formule du ROI :
ROI = (Bénéfice net / Coût de l’investissement) x 100
Sur cette base, vous pourrez établir un budget pour le logiciel de facturation électronique et négocier des prix avantageux avec les fournisseurs en fonction de votre volume et de vos besoins.
4. Faites des recherches et dressez une liste restreinte de logiciels
Faites des recherches sur les différents fournisseurs de logiciels de facturation électronique. Consultez des plateformes de commentaires et des blogs, comme le nôtre. Ensuite, allez sur le site Web des fournisseurs pour consulter les dernières informations sur les prix et les fonctionnalités. Si la plateforme propose des démos ou des essais gratuits, utilisez-les pour tester l’ergonomie du logiciel.
Pour vous faciliter la tâche, créez une liste de critères ou un tableau Excel. Utilisez-le pour répertorier les paramètres prioritaires et vos impressions sur chaque plateforme. Cela vous aidera à comparer plus facilement. Après vos recherches et tests, dressez une liste restreinte de 2 à 3 options principales.
5. Évaluez et sélectionnez
Organisez des démonstrations avec vos fournisseurs présélectionnés. Posez-leur des questions spécifiques à vos besoins et préoccupations. Par exemple, comment le logiciel gère-t-il l’intégration avec votre système comptable existant ? Comparez les fonctionnalités, les prix et les options d’assistance proposées par chaque fournisseur. Choisissez le logiciel qui correspond le mieux à vos besoins, à votre budget et à vos objectifs à long terme.
6. Implémentez et suivez les performances
Développez un plan détaillé pour l’implémentation, y compris la formation de votre équipe. Définissez et suivez les indicateurs clés de performance (KPI) tels que le temps de traitement des factures, les taux de paiement et la satisfaction client. Cela vous permettra de suivre le ROI réel et d’ajuster la stratégie si nécessaire.
Conclusion
Avec Klippa, vous pouvez automatiser vos flux de travail de traitement des factures et échanger directement des factures électroniques via le réseau Peppol. Économisez de l’argent et réduisez les efforts de mise en œuvre en obtenant immédiatement un ID avec Klippa, votre point d’accès certifié Peppol.
Utilisez notre plateforme IDP pour automatiser vos flux de documents et simplifier vos besoins en matière de facturation électronique. Assurez-vous de rester conforme aux dernières réglementations en matière de facturation électronique tout en économisant du temps et de l’argent sur le traitement des factures
FAQ
Un système de facturation électronique est une solution numérique qui permet aux entreprises de créer, envoyer, recevoir, traiter et suivre des factures de manière dématérialisée. Il supprime le besoin de papier ou de PDF, simplifie le processus de facturation et garantit la conformité aux réglementations en vigueur.
Une facture numérique est généralement un PDF ou une copie numérisée d’une facture papier, tandis qu’une e-facture est générée et traitée dans un format structuré (comme XML ou UBL) permettant une intégration directe avec les systèmes financiers.
L’EDI (Échange de Données Informatisé) est un système plus large permettant l’échange de documents commerciaux sous un format structuré entre entreprises. La facturation électronique se concentre spécifiquement sur l’échange de factures électroniques, souvent via des réseaux comme PEPPOL, afin d’assurer la conformité aux exigences fiscales et réglementaires.